Descripció del projecte
L’impacte que l’escassedat d’aigua i els fenòmens extrems associats al canvi climàtic tindran en la producció animal requereix d’estudis que aportin noves dades sobre l’ocurrència i els riscos que suposa la presència de virus patògens en aigües i altres matrius ambientals que poden ser reutilitzades en ramaderia com a aigua de beguda o per a la neteja.
Tanmateix aquestes metodologies han d’estar a disposició d’aquells agents amb capacitat per a realitzar aquest monitoratge. Aquest projecte té com a principals objectius:
1) Optimitzar metodologies per a la detecció de virus d’interès veterinari en aigua i altres mostres ambientals com purins i el component líquid d’aquests.
2) Aplicar tècniques de metagenòmica a la detecció i caracterització dels virus presents en aquestes mostres.
3) Avaluar quins mètodes d’inactivació de patògens son més efectius per a la inactivació o reducció de virus d’interès veterinari en mostres d’aigua.
En aquest projecte es posaran a punt mètodes per a l’estudi de l’ocurrència de virus patògens animals en aigua emprada en la producció de porcs.
Per una banda s’optimitzarà l’ús de mostrejadors passius per al mostreig i concentració de virus a partir de mostres d’aigua i per l’altra de mètodes per a concentració de virus a partir de mostres de purins i lixiviats d’origen porcí.
S’avaluarà també l’efectivitat que tenen per a l’eliminació de virus els mètodes d’inactivació de patògens actualment emprats en la desinfecció d’aigua de beguda per als porcs (clor, ozó, filtració, UV, llacunatge). Amb la intenció d’estudiar quins virus circulen en l’aigua emprada en la producció porcina s’aplicaran tècniques de metagenòmica dirigida amb la plataforma Illumina a mostres d’aigua, purins o lixiviats.
Tanmateix per a caracteritzar aquelles soques víriques circulants de virus amb especial impacte en la indústria del porc com podria ser el Virus de la Síndrome Respiratòria i Reproductiva Porcina (PRRSV), s’aplicarà la tècnica de l’Amplicon Deep Sequencing a partir de mostres positives per aquest virus i altres virus d’interès.
Aquest projecte es durà a terme entre el Laboratori de Virus Contaminants d’Aigua i Aliments de la Universitat de Barcelona i el Grup de Sanejament Porcí (GSP) amb la intenció final que les metodologies optimitzades puguin ser transferides a GSP per a la seva aplicació rutinària.
